MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.01

Total Repeats: 2435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019739	GAC	2	6	158	163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314406
2	NC_019739	GCTT	2	8	207	214	0 %	50 %	25 %	25 %	428314406
3	NC_019739	AAC	2	6	319	324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314406
4	NC_019739	CAGC	2	8	332	339	25 %	0 %	25 %	50 %	428314406
5	NC_019739	CAC	2	6	342	347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314406
6	NC_019739	G	6	6	381	386	0 %	0 %	100 %	0 %	428314406
7	NC_019739	TTG	2	6	388	393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314406
8	NC_019739	GGGT	2	8	430	437	0 %	25 %	75 %	0 %	428314406
9	NC_019739	AGC	2	6	520	525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314406
10	NC_019739	ACT	2	6	532	537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314406
11	NC_019739	CAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314406
12	NC_019739	CAA	3	9	588	596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314406
13	NC_019739	GTT	2	6	624	629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314406
14	NC_019739	TCA	2	6	642	647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314406
15	NC_019739	AGC	3	9	684	692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314407
16	NC_019739	ACC	2	6	741	746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314407
17	NC_019739	GCT	3	9	754	762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314407
18	NC_019739	GTT	2	6	826	831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314407
19	NC_019739	TCA	2	6	925	930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314407
20	NC_019739	TCC	2	6	975	980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314407
21	NC_019739	GA	3	6	988	993	50 %	0 %	50 %	0 %	428314407
22	NC_019739	TC	3	6	998	1003	0 %	50 %	0 %	50 %	428314407
23	NC_019739	CAT	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314407
24	NC_019739	TCA	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314407
25	NC_019739	CAA	2	6	1073	1078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314407
26	NC_019739	CCCT	2	8	1098	1105	0 %	25 %	0 %	75 %	428314407
27	NC_019739	TGGG	2	8	1153	1160	0 %	25 %	75 %	0 %	428314407
28	NC_019739	GATT	2	8	1205	1212	25 %	50 %	25 %	0 %	428314407
29	NC_019739	A	6	6	1398	1403	100 %	0 %	0 %	0 %	428314407
30	NC_019739	AT	3	6	1436	1441	50 %	50 %	0 %	0 %	428314407
31	NC_019739	AAGG	2	8	1472	1479	50 %	0 %	50 %	0 %	428314407
32	NC_019739	ATT	2	6	1500	1505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314407
33	NC_019739	CAG	2	6	1508	1513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314407
34	NC_019739	GCT	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314407
35	NC_019739	GA	3	6	1748	1753	50 %	0 %	50 %	0 %	428314407
36	NC_019739	GCG	2	6	1901	1906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314407
37	NC_019739	GTT	2	6	1951	1956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314407
38	NC_019739	CTT	2	6	1991	1996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314407
39	NC_019739	AGA	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314407
40	NC_019739	TGAT	2	8	2116	2123	25 %	50 %	25 %	0 %	428314407
41	NC_019739	TAGA	2	8	2126	2133	50 %	25 %	25 %	0 %	428314407
42	NC_019739	CAT	2	6	2246	2251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314407
43	NC_019739	GA	3	6	2262	2267	50 %	0 %	50 %	0 %	428314407
44	NC_019739	GTT	2	6	2341	2346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314407
45	NC_019739	GAC	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314407
46	NC_019739	GAA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314407
47	NC_019739	ATT	2	6	2507	2512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314408
48	NC_019739	TTC	2	6	2558	2563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314408
49	NC_019739	GGC	2	6	2613	2618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314408
50	NC_019739	GAAACT	2	12	2794	2805	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428314408
51	NC_019739	AAGG	2	8	3049	3056	50 %	0 %	50 %	0 %	428314408
52	NC_019739	CCAA	2	8	3062	3069	50 %	0 %	0 %	50 %	428314408
53	NC_019739	TC	3	6	3083	3088	0 %	50 %	0 %	50 %	428314408
54	NC_019739	AGA	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314408
55	NC_019739	GTG	3	9	3140	3148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314408
56	NC_019739	CGT	2	6	3187	3192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314408
57	NC_019739	GCAC	2	8	3418	3425	25 %	0 %	25 %	50 %	428314409
58	NC_019739	GCG	2	6	3540	3545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314409
59	NC_019739	GTT	2	6	3553	3558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314409
60	NC_019739	AGA	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314409
61	NC_019739	TGA	2	6	3582	3587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314409
62	NC_019739	CTT	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314409
63	NC_019739	GGC	2	6	3754	3759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314409
64	NC_019739	CAA	2	6	3842	3847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314409
65	NC_019739	GCC	2	6	3937	3942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314409
66	NC_019739	CAC	2	6	4046	4051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314409
67	NC_019739	CTC	2	6	4065	4070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314409
68	NC_019739	ATCTG	2	10	4081	4090	20 %	40 %	20 %	20 %	428314409
69	NC_019739	GTA	2	6	4127	4132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314409
70	NC_019739	GAC	2	6	4237	4242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314409
71	NC_019739	C	6	6	4244	4249	0 %	0 %	0 %	100 %	428314409
72	NC_019739	GAA	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314409
73	NC_019739	TCA	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314409
74	NC_019739	GCC	2	6	4324	4329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314409
75	NC_019739	AAC	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314409
76	NC_019739	ATGAC	2	10	4379	4388	40 %	20 %	20 %	20 %	428314409
77	NC_019739	GTT	2	6	4405	4410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314409
78	NC_019739	TTC	2	6	4419	4424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314409
79	NC_019739	GA	3	6	4513	4518	50 %	0 %	50 %	0 %	428314409
80	NC_019739	CCAC	2	8	4520	4527	25 %	0 %	0 %	75 %	428314409
81	NC_019739	TGC	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314409
82	NC_019739	TCGGTT	2	12	4547	4558	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428314409
83	NC_019739	GATGGT	2	12	4573	4584	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428314409
84	NC_019739	GTTG	2	8	4621	4628	0 %	50 %	50 %	0 %	428314409
85	NC_019739	AGTTG	2	10	4642	4651	20 %	40 %	40 %	0 %	428314409
86	NC_019739	GGT	2	6	4669	4674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314409
87	NC_019739	CAC	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314409
88	NC_019739	G	6	6	4713	4718	0 %	0 %	100 %	0 %	428314409
89	NC_019739	AGA	2	6	4725	4730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314409
90	NC_019739	GAG	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314409
91	NC_019739	GGT	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314409
92	NC_019739	TAG	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314409
93	NC_019739	GAAGGA	2	12	4807	4818	50 %	0 %	50 %	0 %	428314409
94	NC_019739	TTA	2	6	4828	4833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314409
95	NC_019739	AC	3	6	4841	4846	50 %	0 %	0 %	50 %	428314409
96	NC_019739	GAG	2	6	4853	4858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314409
97	NC_019739	GCC	2	6	4897	4902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314409
98	NC_019739	AGTGGG	2	12	4965	4976	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428314409
99	NC_019739	GAG	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314409
100	NC_019739	CCA	2	6	5056	5061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314409
101	NC_019739	ACCAA	2	10	5077	5086	60 %	0 %	0 %	40 %	428314409
102	NC_019739	CCG	3	9	5087	5095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314409
103	NC_019739	TTG	2	6	5111	5116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314409
104	NC_019739	GTC	2	6	5148	5153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314409
105	NC_019739	AAT	2	6	5155	5160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314409
106	NC_019739	GA	3	6	5168	5173	50 %	0 %	50 %	0 %	428314409
107	NC_019739	ATC	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314409
108	NC_019739	TCA	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314409
109	NC_019739	TCA	2	6	5296	5301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314409
110	NC_019739	ATT	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314409
111	NC_019739	TTG	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314409
112	NC_019739	TCA	2	6	5402	5407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314409
113	NC_019739	CCA	2	6	5599	5604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314410
114	NC_019739	GAG	2	6	5638	5643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314410
115	NC_019739	GTT	2	6	5676	5681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314410
116	NC_019739	CCTT	2	8	5785	5792	0 %	50 %	0 %	50 %	428314410
117	NC_019739	TCA	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314410
118	NC_019739	T	6	6	5906	5911	0 %	100 %	0 %	0 %	428314410
119	NC_019739	CAC	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314410
120	NC_019739	GTA	2	6	5955	5960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314410
121	NC_019739	GA	3	6	5984	5989	50 %	0 %	50 %	0 %	428314410
122	NC_019739	AGG	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314410
123	NC_019739	T	7	7	5999	6005	0 %	100 %	0 %	0 %	428314410
124	NC_019739	CAT	2	6	6097	6102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314410
125	NC_019739	GAGG	2	8	6208	6215	25 %	0 %	75 %	0 %	428314411
126	NC_019739	C	6	6	6227	6232	0 %	0 %	0 %	100 %	428314411
127	NC_019739	TCC	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314411
128	NC_019739	CTG	2	6	6286	6291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314411
129	NC_019739	AAT	2	6	6338	6343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314411
130	NC_019739	CTA	2	6	6382	6387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314411
131	NC_019739	AAT	2	6	6395	6400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314411
132	NC_019739	GAA	2	6	6431	6436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314411
133	NC_019739	GAA	2	6	6475	6480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314411
134	NC_019739	AGA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314411
135	NC_019739	CAGC	2	8	6569	6576	25 %	0 %	25 %	50 %	428314411
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